MISIÓN:
Ser el organismo que fomenta la enseñanza y la práctica de las ciencias farmacéuticas en México a través de la evaluación y acreditación periódica de los programas académicos a todos los niveles establecidos por Copaes, en las instituciones de educación superior y de proveedores de educación continua del área de Farmacia.
VISIÓN:
El COMAEF es un organismo acreditador, autónomo e imparcial que reconoce la calidad de los programas académicos en las áreas del conocimiento de las ciencias farmacéuticas de todos los niveles educativos que imparten las instituciones de educación superior públicas y privadas, así como los programas académicos de educación continua del área farmacéutica que proporcionen instituciones de educación, industria, asociaciones profesionales o cualquier proveedor de educación continua.